В 1970 году на базе одного из отделений детской городской больницы было перепрофилировано 20 коек для лечения новорожденных. Заведование этим отделением поручили А.А.Косенко, старшей медсестрой была назначена Ю.С. Григорьева.   После  переезда в новое здание детской городской больницы в 1980 году на ул. Больничная д.45 отделение уже насчитывало 60 коек, 20 из которых предназначались для выхаживания недоношенных детей второго этапа. 
В 1989 году отделение переводится в новое, специально построенное здание на территории областной больницы по ул. Воронкова 26. 
В 1995 году в связи с созданием ГАУЗ АО «АОДКБ» отделение переходит в его структуру. 

В настоящее время оснащение отделения дает возможность проводить лечение в палате совместного пребывания матери с ребенком, проводить круглосуточное мониторирование жизненно важных функций пациента, выхаживать недоношенных младенцев в максимально комфортных условиях кувеза, проводить длительную инфузионную терапию, фототерапию, ингаляционную терапию с возможностью воздействовать на нужный уровень дыхательной системы.

На базе ГАУЗ АО «АОДКБ» проводятся постановка субгалиальных и вентрикулоперитониальных шунтов при постгеморрагической гидроцефалии, лазерная коагуляция сетчатки глаза при ретинопатии недоношенных, оперативное лечение врожденных пороков легких, желудочно - кишечного тракта, мочевыделительной системы, а также операции при некротическом энтероколите.

Сотрудники отделения накопили большой опыт выхаживания пациентов в после операционном периоде с такими непростыми проблемами как синдром «короткой кишки», воспалительный процесс мочевого тракта, нейроинфекции. Составляются индивидуальные программы парентерального и энтерального питания, что позволяет пациентам развиваться физически и психоматорно в соответствии с физиологической нормой, предотвращает развитие остеопении недоношенных, которая имеет тяжелые последствия для ребенка.
Результатом совместного труда неонатальных реаниматологов, сотрудников отделения патологии новорожденных и недоношенных детей явилось снижение длительности пребывания ребенка в стационаре, значительно уменьшилась летальность, заболеваемость гнойно-септической патологией, проводится работа по профилактике детской инвалидности.

ОСНОВНЫЕ ФУНКЦИИ  ОТДЕЛЕНИЯ

Основным направлением в работе является специализированная и высококвалифицированная медицинская помощь новорожденным и недоношенным детям с заболеваниями и патологическими состояниями в соответствии с действующими порядками, клиническими рекомендациями, с учетом стандартов медицинской помощи, на основе принципов доказательной медицины:
• систематическая поддержка грудного вскармливания, как основа гармоничного физического и умственного развития детей;
• лечение и реабилитация детей до 3 месяцев с неврологическими заболеваниями, возникшими в результате тяжелой асфиксии, родовой травмы, гнойно-септической патологией, недоношенных детей рожденных с экстремально низкой и очень низкой массой тела, врожденными пороками развития, а также детей с хирургической и нейрохирургической патологией в позднем послеоперационном периоде;
• обследование и лечение детей с врожденными пороками сердца, нарушениями ритма сердца и проводимости различной этиологии;
• консультация пациентов профильными специалистами (невролог, кардиолог, пульмонолог, гастроэнтеролог, офтальмолог, хирург, уролог, гинеколог, ортопед, отоларинголог);
• проведение аудиологического скрининга;
• пассивная иммунизация пациентов;
• при наличии медицинских показаний к оказанию высокотехнологичной медицинсой помощи на базе ведущих медицинских центров России проводится телемедицинские консультации, подготовка документов, транспортировка новорожденных детей в медицинскую организацию, оказывающую данный вид помощи;
• проведение санитарно-просветительной работы с матерями и родственниками новорожденных

Сотрудники отделения имеют стаж работы на одном месте от 5 до 30 лет. Специалисты своевременно повышают свою квалификацию.